A SkyDrive sok szempontból jobb, mint konkurensei (a korán regisztrálók például 25 Gbájt tárhelyet kaptak 7 helyett), de azért akadnak benne hiányosságok is. Ezek közül a legfontosabb egészen mostanáig az volt, hogy nem lehetett megválasztani, hogy a számítógépen melyik mappa tartalmát szeretnénk szinkronizálni és melyikét nem.